“這是預言哦。你們五人，終會迎來重大的危機。那時，能夠保護大家的人是你” 　　小時候曾遭到綁架的高中2年級生·堂島大介，與兒時的好友剴、露、瑪麗瑪麗、慶作一起，被卷入了不可思議的現象——“澀谷漂流”。 
　　澀谷的中心部跳躍到了300多年以后的“未來”。等在那里的是廣袤無邊的荒野與森林、散布各處的廢墟……以及未來人“revisions”和他們所操縱的巨大機械怪物。 
　　不明原因地遭到怪物蹂躪的澀谷，如同前來拯救它一般而現身的是，與綁架事件中大介的恩人同名且相貌一模一樣的少女·米洛。她為大介等人提供了只有他們能夠操縱的人形兵器“提線木偶”，并要求他們守護澀谷。 
　　綁架事件的恩人——米洛的預言“守護同伴的命運”，深信著此事活下去的大介，為終將到訪的危機以及獲得的力量而歡喜。但，5名兒時好友的牽絆由于綁架事件的影響，而變得四分五裂。 
　　孤立的城市。未知的敵人。未確定的過去與命運的預言。少年少女們，為了取回“現在”而與“未來”戰斗。一定要回到原本的時代——